Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf18Q7TS55 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf18Q7TS55 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf18Q7TS55 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf18Q7TS55 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf18Q7TS55 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf18Q7TS55 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tnfsf18Q7TS55 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tnfsf18Q7TS55 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tnfsf18Q7TS55 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tnfsf18Q7TS55 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms