Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc93Q7TQK5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms