Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms