Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TwistnbQ78WZ7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TwistnbQ78WZ7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TwistnbQ78WZ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TwistnbQ78WZ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TwistnbQ78WZ7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TwistnbQ78WZ7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TwistnbQ78WZ7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TwistnbQ78WZ7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms