Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed3Q78IS1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms