Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nme8Q715T0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nme8Q715T0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms