Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup188Q6ZQH8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms