Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Topbp1Q6ZQF0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Topbp1Q6ZQF0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms