Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms