Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ino80Q6ZPV2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms