Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn5Q6VZZ7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Opn5Q6VZZ7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn5Q6VZZ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn5Q6VZZ7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn5Q6VZZ7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn5Q6VZZ7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn5Q6VZZ7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn5Q6VZZ7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn5Q6VZZ7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.3 ms