Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Timd4Q6U7R4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timd4Q6U7R4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms