Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja6Q6S5G4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms