Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc154Q6RUT8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc154Q6RUT8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms