Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b4Q6Q477 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms