Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms