Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sort1Q6PHU5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms