Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bms1Q6PGF5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bms1Q6PGF5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bms1Q6PGF5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bms1Q6PGF5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bms1Q6PGF5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bms1Q6PGF5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms