Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf316Q6PGE4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf316Q6PGE4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Znf316Q6PGE4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Znf316Q6PGE4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Znf316Q6PGE4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf316Q6PGE4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf316Q6PGE4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf316Q6PGE4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf316Q6PGE4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf316Q6PGE4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf316Q6PGE4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf316Q6PGE4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf316Q6PGE4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms