Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc82Q6PG04 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc82Q6PG04 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc82Q6PG04 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc82Q6PG04 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc82Q6PG04 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms