Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff1Q6PFE7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.6 ms