Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc46a1Q6PEM8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a1Q6PEM8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms