Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc36Q6PDM4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms