Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Srsf1Q6PDM2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms