Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SvoplQ6PDF3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms