Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.9 ms