Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gapvd1Q6PAR5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gapvd1Q6PAR5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms