Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo4Q6PAQ4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo4Q6PAQ4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo4Q6PAQ4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo4Q6PAQ4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo4Q6PAQ4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo4Q6PAQ4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo4Q6PAQ4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo4Q6PAQ4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo4Q6PAQ4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo4Q6PAQ4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms