Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D4

Cep135, Centrosomal protein of 135 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep135Q6P5D4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Cep135Q6P5D4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cep135Q6P5D4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Cep135Q6P5D4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Cep135Q6P5D4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Cep135Q6P5D4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Cep135Q6P5D4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Cep135Q6P5D4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Cep135Q6P5D4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Cep135Q6P5D4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Cep135Q6P5D4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Cep135Q6P5D4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cep135Q6P5D4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms