Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp12Q6P5B0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp12Q6P5B0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp12Q6P5B0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms