Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sik3Q6P4S6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sik3Q6P4S6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms