Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Podnl1Q6P3Y9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Podnl1Q6P3Y9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms