Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms