Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZR2

Msantd2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd2Q6NZR2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msantd2Q6NZR2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msantd2Q6NZR2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms