Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms