Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Asic1Q6NXK8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms