Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HelbQ6NVF4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms