Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr44Q6NVE8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr44Q6NVE8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms