Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdcd11Q6NS46 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdcd11Q6NS46 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms