Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap20Q6IFT4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms