Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6GQU0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6GQU0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms