Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms