Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ltn1Q6A009 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms