Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF3

Gba2, Non-lysosomal glucosylceramidase, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gba2Q69ZF3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gba2Q69ZF3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gba2Q69ZF3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gba2Q69ZF3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gba2Q69ZF3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms