Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn4Q69Z26 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms