Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp4Q68FH0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms