Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms