Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF6

Git1, ARF GTPase-activating protein GIT1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Git1Q68FF6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Git1Q68FF6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms