Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2bQ64511 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Top2bQ64511 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Top2bQ64511 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms