Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gja3Q64448 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms